Химическая опасность
На территории города имеется один химически опасный объект - ООО «Юганскводоканал», степень угрозы для населения - незначительная. В 2008 году на объекте установлена локальная система оповещения.
Проблемными вопросами являются значительный износ основных производственных фондов.

Потенциальные опасности в промышленности
На территории города Нефтеюганска аварий на объектах повышенной опасности и промышленных объектах, представляющих угрозу для жизни населения, не зафиксировано.
Проблемными вопросами являются значительный износ основных производственных фондов промышленных объектов.